La mapoteca es indispensable para los alumnos de todas las divisiones de esta Institución pues cada línea de investigación académica requiere saber con exactitud la ubicación de cada destino, espacio, ruta, proporciones, estado y condiciones de determinado terreno en la vasta geografía chiapaneca. Su acceso es ilimitado y se rige por un control interno de flujo de visitas y un historial de consulta de materiales.
En esta área se encuentran concentradas tanto la cartografía del estado de Chiapas y algunas otras cartas geográficas importantes; su acopio es provisto y actualizado periódicamente por el INEGI y su desarrollo es parte de los servicios originales de este departamento.